SI3440 Makromolekylers konformationer 10,0 hp

Conformations of Macromolecules

  • Utbildningsnivå

    Forskarnivå
  • Kursnivå (A-D)

    D
  • Huvudområde

  • Betygsskala

Det finns inget planerat kurstillfälle.

Lärandemål

Doktoranden ska efter genomgången kurs kunna:

  • tillämpa statistisk mekanik på makromolekyler.
  • genomföra och inse begränsningarna med de olika approximationer som krävs för att studera polymerproblem.
  • behärska tillämpning av renomeringsmetoder på polymerproblem.
  • känna till olika modeller för polymerdynamik.
  • tillämpa polymerfysik på biologiska makromolekyler.

Kursens huvudsakliga innehåll

Karakterisering av monomerer och makromolekyler. Konformationer. 'Slumpartade' strukturer och olika matematiska modeller för att beskriva dessa. Uteslutna volym-problemet. Flory-Huggins teori. Växelverkningar mellan närliggande atomgrupper och deras inflytande på molekylstrukturerna. Karakterisering av några olika polymerer från denna utgångspunkt. Proteiner. Aminosyrors konformationer och växelverkningar mellan närliggande grupper. Ramachandran-diagram. Några struktur-typer -spiraler, -flak. Metoder att förutsäga strukturer. Nukleinsyror, DNA, RNA. Karaktärisering av nukleotiders konformationer. Olika spiralstrukturer. Kopplingar mellan baspar. Något om polymermaterial, olika tillstånd och övergångar. Skalnings-egenskaper; dynamik baserad på skalningsidéer.

Behörighet

Litteratur

  • P.J. Flory, Statistical Mechanics of Chain Molecules, Interscience Publisher 1969.
  • P.G. des Gennes, Scaling Concepts in Polymer Physics. Cornell Univ. Press, 1979.
  • G.E. Schultz, R.H. Schirmer, Principles of Protein Structure, Springer, 1979.

Examination

Krav för slutbetyg

Inlämningsuppgifter i kombination med muntlig tentamen.

Ges av

SCI/Fysik

Kontaktperson

Berk Hess

Examinator

Berk Hess <hess@kth.se>

Versionsinformation

Kursplan giltig från och med VT2009.