Hoppa till huvudinnehållet
Till KTH:s startsida Till KTH:s startsida

CB2110 Tillämpad proteomik 7,5 hp

Kursen i tillämpad proteomik är ett program på avancerad nivå utformat för masterstudenter som vill fördjupa sin förståelse för proteiner och deras roll i biologiska system, både sjuka som friska. Området som kallas för proteomik innefattar storskaliga proteinstudier, vilket numera spelar en central roll inom life science. Denna kurs kommer att ge studenter kunskap som ger ett omfattande grepp om proteomiken och dess principer, tekniker och metoder, med särskild tonvikt på masspektrometribaserad proteomik och hur den kan integreras med andra omicsdiscipliner. Studenterna i kursen får praktisk erfarenhet av dataanalys och tolkning av resultat som tagits fram med den senaste proteomik-teknologin, samtidigt som de utforskar potentialen i dessa dataset och dess tillämpningar inom medicin, bioteknik och miljövetenskap. Kursen kommer att utrusta eleverna med värdefulla färdigheter för att kunna hantera proteomik-data och kursen kommer att ge dem verktyg för att aktivt kunna analysera storskaliga dataset som tagits fram med teknologier som masspektrometri eller proximity extension assays. I huvudsak ger kursen Tillämpad proteomik en praktisk, omfattande inblick i proteomik-fältet med fokus på dataanalys. Fokus kommer att ligga på dataanalys och enbart datalaborationer kommer att erbjudas inom kursmodulen.

Välj termin och kursomgång

Välj termin och kursomgång för att se aktuell information och mer om kursen, såsom kursplan, studieperiod och anmälningsinformation.

Kursval

Gäller för kursomgång

HT 2024 Start 2024-08-26 programstuderande

Anmälningskod

51240

Rubriker med innehåll från kursplan CB2110 (HT 2024–) är markerade med en asterisk ( )

Innehåll och lärandemål

Kursinnehåll

Denna kurs introducerar studenterna till principer, tekniker och tillämpningar inom proteomik. Studenterna kommer att lära sig grunderna i proteinseparation, identifiering och kvantifiering med hjälp av masspektrometri, samt hur dessa tekniker kan tillämpas inom olika områden som medicin, bioteknik och miljövetenskap. Kursen kommer även att täcka dataanalys och tolkning, samt integration av proteomik med andra omiks-teknologier. De delar som kursen innehåller är:

  • Introduktion till proteomik
  • Grundläggande proteinseparationstekniker och introduktion till masspektrometri
  • Tillämpad proteomik
  • Proteinidentifiering och kvantifiering
  • Dataanalys och integrering med mellan olika omiks-teknologier
  • Biomarkörsanalys och precisionsmedicin
  • Nuvarande utmaningar och framtida riktning

Lärandemål

Syftet med kursen är att ge studenterna en introduktion till aktuella metoder, utmaningar och tillämpningar inom området proteomik med fokus på masspektrometri-baserade analysmetoder. Efter avslutad kurs ska studenterna ha en djupgående förståelse för olika avancerade metoder inom området för masspektrometri-baserad proteomik samt metoder för proteinanalys av komplexa system. Studenterna skall kunna beskriva principerna bakom dessa tekniker och deras specifika tillämpningar inom området för bioteknologi. Efter avslutad kurs ska studenterna kunna:

Syftet med kursen är att ge studenterna en introduktion till aktuella metoder, utmaningar och tillämpningar inom området proteomik med fokus på masspektrometri-baserade analysmetoder. Efter avslutad kurs ska studenterna ha en djupgående förståelse för olika avancerade metoder inom området för masspektrometri-baserad proteomik samt metoder för proteinanalys av komplexa system. Studenterna skall kunna beskriva principerna bakom dessa tekniker och deras specifika tillämpningar inom området för bioteknologi. Efter avslutad kurs ska studenterna kunna:

1. Analysera och utvärdera resultat från proteomik-teknologier (TEN1, LAB1)

  • Kritiskt utvärdera principer, styrkor och begränsningar för olika proteomik-teknologier. 
  • Identifiera och diskutera experimentella design och dataanalys med fokus på proteinkvantifiering.

Aktivt Delta i Vetenskapliga Diskussioner inom området för Proteomik

  • Engagera sig i vetenskapliga diskussioner om proteomik-teknologier och deras tillämpningar inom life science.
  • Kritiskt utvärdera vetenskapliga resultat från proteomik-experiment (TEN1, LAB1)

Analysera och tolka proteomik-data från vetenskapliga artiklar och experimentella studier. 

  • Bedöma och granska forskningsresultat och därefter analysera deras pålitlighet och relevans baserat på relevanta statistiska metoder.

Kurslitteratur och förberedelser

Särskild behörighet

En kandidatexamen motsvarande minst 180 ECTS, samt kurser motsvarande minst 20 ECTS i livsvetenskaper och 10 ECTS i matematik (eller liknande). 

Rekommenderade förkunskaper

Ingen information tillagd

Utrustning

Ingen information tillagd

Kurslitteratur

Ingen information tillagd

Examination och slutförande

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

Betygsskala

A, B, C, D, E, FX, F

Examination

  • LAB1 - Datorlaboration, 2,5 hp, betygsskala: P, F
  • TEN1 - Skriftlig tentamen, 5,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Möjlighet till komplettering

Ingen information tillagd

Möjlighet till plussning

Ingen information tillagd

Examinator

Ingen information tillagd

Etiskt förhållningssätt

  • Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
  • Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
  • Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ytterligare information

Kursrum i Canvas

Registrerade studenter hittar information för genomförande av kursen i kursrummet i Canvas. En länk till kursrummet finns under fliken Studier i Personliga menyn vid kursstart.

Ges av

Huvudområde

Bioteknik

Utbildningsnivå

Avancerad nivå

Påbyggnad

Ingen information tillagd

Övrig information

Delar av kursinnehållet delas med CB2080 Proteomics 7.5. Totalt 3 hp. Överlappande modul TEN1.