In English

BB2440 Bioinformatik och biostatistik 7,0 hp

Bioinformatics and Biostatistics

Detta är en grundläggande kurs i bioinformatik och biostatistik. Kursen riktar sig huvudsakligen till studenter på mastersprogrammen i Medicinsk bioteknologi och i Industriell & miljöinriktad bioteknologi. Kursen består av föreläsningar och datorbaserade laborationer.

  • Utbildningsnivå

    Avancerad nivå

  • Kursnivå (A-D)

    D

  • Huvudområde

    Bioteknik

  • Betygsskala

    A, B, C, D, E, FX, F

Kurstillfällen/kursomgångar

HT13 för programstuderande

HT13 för programstuderande

  • Perioder

    HT13 P1 (7,0 hp)

  • Anmälningskod

    50395

  • Kursen startar

    2013 vecka: 36

  • Kursen slutar

    2013 vecka: 44

  • Undervisningsspråk

    Engelska

  • Campus

    AlbaNova

  • Antal föreläsningar

  • Antal övningar

  • Undervisningstid

    Dagtid

  • Undervisningsform

    Normal

  • Antal platser

    Ingen begränsning

  • Schema

    Schema (nytt fönster)

  • Kursansvarig

    Anders Andersson <andand@kth.se>

  • Målgrupp

    Sökbar endast för SWB

Lärandemål

Detta är en grundläggande kurs i bioinformatik och biostatistik. Efter att ha blivit godkänd på kursen bör studenten:

  • kunna teorin bakom grundläggande bioinformatiska analysmetoder.
  • känna till de viktigaste bioinformatiska databaserna.
  • kunna redogöra för grundläggande sannolikhets- och statistikbegrepp.
  • kunna beskriva för molekylärbiologiska data relevanta statistiska metoder och sannolikhetsfördelningar.
  • känna till tillämpbarheten för och begränsningarna av olika bioinformatiska och statistiska metoder.
  • kunna utföra och tolka bioinformatiska och statistiska analyser på molekylärbiologiska data.

Kursens huvudsakliga innehåll

Kursupplägg

Kursen består av föreläsningar och datorbaserade laborationer.

Behörighet

Minst 150 högskolepoäng från årskurs 1, 2 och 3 varav minst 100 högskolepoäng från årskurs 1 och 2 samt kandidatexamensarbete måste vara avklarade. I de 150 poängen skall ingå avklarade kurser motsvarande minst 20 hp matematik, numeriska metoder, data, varav minst 5 hp utgörs av numeriska metoder och data, 20 hp kemi där även kurs i kemisk mätteknik kan ingå samt 20 hp bioteknik eller molekylärbiologi

Rekommenderade förkunskaper

Följande kurser, eller motsvarande, rekommenderas: SF1644 Analys i en variabel, BB1010 Introduktion till bioteknologi. Datorvana motsvarande DN1212 Numeriska metoder och grundläggande programmering.

Litteratur

  • Zvelebil and Baum, Understanding Bioinformatics (2007), Garland Science
  • M. J. Crawley, Statistics: An Introduction Using R (Wiley)

Listan kan komma att ändras. Ändringar kommer att annonseras på kursens hemsida senast fyra veckor före kursstart.

Examination

  • LAB1 - Laboration, 2,0 hp, betygsskala: P, F
  • TEN1 - Skriftlig Tentamen, 5,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Krav för slutbetyg

Skriftlig examen (TEN1; 5.0 hp, betygsskala A-F),

Laborationskurs med skriftliga rapporter (LAB1; 2.0 hp, betygsskala godkänd(P)/underkänd(F)

Ges av

BIO/Bioteknologi - gru

Examinator

Anders Andersson <andand@kth.se>

Övrig information

Anmälan senast två veckor innan tentamen är obligatorisk.

Kursen ges under förutsättning att minst sju studenter tackar ja till erbjuden plats.

Versionsinformation

Kursplan giltig från och med HT11.
Examinationsinformation giltig från och med HT10.