Välkommen till en kurs som både ger en bred introduktion i biokemi och som beskriver biotekniska tillämpningar med kopplingar till Grön Kemi och hållbarhet som är viktiga för kemister!
Kurs-PM VT 2021
Presentation av kursen
Rubriker markerade med en asterisk ( * ) kommer från kursplan version VT 2021
Innehåll och lärandemål
Kursinnehåll
Kursen avser att ge inledande teoretiska kunskaper i biokemi samt att ge en introduktion till biotekniken. Tonvikten ligger på cellens makromolekyler proteiner, lipider, nukleinsyror och kolhydrater och fokuserar på deras byggstenar och samverkan i metabolism, fotosyntes och genteknologi.
Kursen innehåller följande delar:
- Prokaryota och eukaryota cellers uppbyggnad och organisation.
- Membraners uppbyggnad och funktion.
- Nukleinsyrors uppbyggnad, biosyntes och funktion i cellens informationsöverföring.
- Proteiners struktur, funktion och biosyntes.
- Enzymers katalytiska funktion och roll i metabolismen.
- De viktigaste (glykolysen, glukoneogenesen, citronsyracykeln) metaboliska processernas uppbyggnad, funktion, interaktion och reglering.
- Energiomsättning vid anaeroba och aeroba betingelser.
- Biotekniska verktyg och tillämpningar.
Lärandemål
Efter godkänd kurs (betyg E) skall studenten uppvisa
Kunskap och förståelse genom att kunna:
- Förklara grundläggande begrepp som beskriver olika typer av cellers struktur och funktion
- Förklara grundläggande begrepp rörande proteiners, nukleinsyrors, lipiders och kolhydraters struktur, funktion och uppbyggnad
- Beskriva vanliga metaboliska reaktionsvägar
Läraktiviteter
Föreläsningar
Under kursen ges totalt 17 föreläsningar som täcker in det mesta av kursens teoretiska innehåll. De flesta föreläsningarna består av inspelat material följt av ett schemalagt tillfälle där vi jobbar med materialet och diskuterar frågor. I samband med varje föreläsning presenteras mer detaljerade kunskapsmål för det ämnesområde som presenteras. Bilderna från föreläsningarna kommer att finnas tillgängliga innan respektive föreläsning. De schemalagda tillfällena som är markerade "Föreläsning" i schemat sker på Zoom.
Övningar
Kursen innehåller sex stycken övningar i halvklass där vi arbetar med frågor kopplade till det teoretiska materialet. Övningarna sker på Zoom. Det är mycket bra att ha en egen molekylbyggsats för att övningarna online ska bli effektiva.
Kontrollskrivning
Kursen innehåller en schemalagd kontrollskrivning efter halva kursen. Den görs digitalt i Canvas på utsatt tid. Kontrollskrivningen följs av en genomgång samma dag. Denna genomgång är obligatorisk för att kunna använda eventuella bonuspoäng till tentamen.
Detaljplanering
Läraktivitet | Innehåll | Förberedelse |
---|---|---|
Föreläsning 1 | Kursintroduktion, celler | |
Föreläsning 2 | Cellen, organisation, uppbyggnad | Inspelat material; Boken, kap 1: 3-16 |
Övning 1 | Kemisk bindning, kemisk struktur och funkt… | Boken, kap 2: 17-33 |
Föreläsning 3 | Aminosyror och proteinstruktur | Inspelat material; Boken, kap 3: 37-47, kap 4: 49-73 |
Övning 2 | Aminosyror och peptider | |
Föreläsning 4 | Protein-tekniker & Enzymer | Inspelat material; Boken, kap 5: 75-102, kap 6: 105-118 |
Föreläsning 5 | Enzymers katalytiska strategier | Inspelat material; Boken, kap 7: 119-141, kap 8: 143-160 |
Övning 3 | Nyckelreaktioner och koenzymer i metabolismen | |
Föreläsning 6 | Lipider och biologiska membran | Inspelat material; Boken, kap 11: 207-220, kap 12: 223-244 |
Övning 4 | Lipider | |
Föreläsning 7 | Kolhydrater | Inspelat material; Boken, kap 10: 181-205 |
Övning 5 | Kolhydrater | |
Föreläsning 8 | DNA | Inspelat material; Boken, kap 33: 673-694, kap 34: 695-714 |
Föreläsning 9 | Från DNA till protein | Inspelat material; Boken, kap 39: 787-802, kap 40: 803-826 |
Kontrollskrivning | ||
Föreläsning 10 | DNA-tekniker | Inspelat material; Boken, kap 41: 827-851 |
Föreläsning 11 | Metabolism-introduktion & glykolysen | Inspelat material; Boken, kap 15: 283-308, kap 16: 311-342 |
Föreläsning 12 | Glukoneogenesen & glykogennedbrytning | Inspelat material; Boken, kap 17: 343-359, kap 24: 485-501 |
Föreläsning 13 | Citronsyracykeln | Inspelat material; Boken, kap 18: 363-375, kap 19: 377-395 |
Föreläsning 14 | Elektrontransportkedjan & oxidativ fosforylering | Inspelat material; Boken, kap 20: 399-418, kap 21: 419-442 |
Föreläsning 15 | Industriell bioteknik | Inspelat material |
Föreläsning 16 | Fotosyntes | Inspelat material; Boken, kap 22: 445-464, kap 23: 465-482 |
Övning 6 | Lösa komplexa bioteknik-frågor i grupp | |
Föreläsning 17 | Summering & kursavslut | |
Examination | Skriftlig tentamen |
Kursens pedagogiska upplägg
De flesta föreläsningarna på kursen använder flipped classroom med förinspelade föreläsningar med efterföljande schemalagda diskussionstillfällen då instuderingsfrågorna gås igenom och det finns möjlighet att ställa frågor. De schemalagda tillfällena spelas inte in.
Inför de flesta schemalagda föreläsningstillfällena förbereder sig studenten genom att titta på de inspelade filmerna och lämna in en skriftlig reflektionsuppgift innan det schemalagda tillfället. 13 st godkända reflektionsuppgifter krävs för att erhålla 2 bonuspoäng till tentan.
Förberedelser inför kursstart
Rekommenderade förkunskaper
Allmän behörighet.
Kurslitteratur
Boken "Biochemistry - A short Course" av Tymoczko, Berg, Gatto och Stryer, 4e upplagan, används på denna kurs. Boken finns tillgänglig som e-bok och är gratis för alla kursdeltagare.
Utrustning
Molekylbyggsats
Kursens övningar kommer endast att gå online under rådande pandemi och vi kan därför inte använda de molekylbyggsatser som vi brukar använda på övningarna i en sal. Därför rekommenderas starkt att köpa en egen molekylbyggsatslåda. Det finns många olika typer men en låda för organisk kemi fungerar bra. På Kårbokhandeln på KTH finns en bra variant. Byggsatsen kan man också använda på kurserna i organisk kemi.
Stöd för studenter med funktionsnedsättning
Om du har en funktionsnedsättning kan du få stöd via Funka:
Funka- stöd för studenter med funktionsnedsättningar
Informera dessutom kursledaren om du har särskilda behov. Visa då upp intyg från Funka.
Examination och slutförande
Betygsskala
A, B, C, D, E, FX, F
Examination
- INLA - Inlämningsuppgift, 1,0 hp, Betygsskala: P, F
- TEN2 - Skriftlig tentamen, 5,0 hp, Betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s samordnare för funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
Avsnittet nedan kommer inte från kursplanen:
Inlämningsuppgift ( INLA )
Denna examinationsmodul examineras genom kontrollskrivningen som behandlar avsnitten Cellbiologi, Bimolekyler & byggstenar och Enzymologi.
Skriftlig tentamen ( TEN2 )
Examineras vid schemalagt tillfälle. Inga hjälpmedel är tillåtna.
Tentan innehåller fem olika avsnitt som var och en utgör en del av kursinnehållet. Under varje avsnitt finns E-betygsfrågor och A-D-betygsfrågor. Avsnitten är olika stora och står i proportion till kursmaterialet. E-frågorna ger maximalt 30 p och A-D-frågorna ger ytterligare max 30 p.
För godkänt (betyg E) på tentamen måste minst 18 p på E-frågorna erhållas. Högre betyg fördelas enligt följande totalpoäng (E-frågor + A-D-frågor): D: 34 p, C: 40 p, B: 46 p, A: 54 p (max: 60 p). För betyget Fx krävs 16 p på E-frågorna eller >16 p på A-D-frågorna.
Eventuella bonuspoäng kan användas på det första tentatillfället och används i första hand för att uppnå gränsen för E och resterande bonuspoäng för att höja betyget.
Bonuspoäng till tentamen
Bonuspoäng till tentamen kan erhållas på två sätt.
- Deltagande i kontrollskrivning samt i efterföljande obligatoriska genomgång ger bonuspoäng till tentan.
- 13 st inlämnade och godkända reflektionsuppgifter (beskrivna under rubriken "Kursens pedagogiska upplägg" ovan) ger 2 bonuspoäng till tentan.
Övriga krav för slutbetyg
Tentamen. (TEN1; 5,0 hp, betygsskala A-F).
Inlämningsuppgift. (INLA; 1,0 hp, betygsskala P/F)
Målrelaterade betygskriterier/bedömningskriterier
För att uppnå betyg E krävs att studenten efter genomgången kurs ska kunna:
- I text återge grundläggande biokemiska begrepp rörande kursens huvudsakliga innehåll (examineras på skriftlig tentamen 5,0 hp och INLA 1,0 hp)
- I text och bild återge olika biomolekylers kemiska namn, funktion och kemiska struktur (examineras på skriftlig tentamen 5,0 hp och INLA 1,0 hp)
- I text och bild förklara grundläggande begrepp kring enzymers funktion som biologiska katalysatorer samt om cellers kolhydratnedbrytande metabolism (examineras på skriftlig tentamen 5,0 hp och INLA 1,0 hp)
För att erhålla högre betyg A-D krävs att studenten efter genomgången kurs ska:
- Kunna tillämpa djupare kunskaper inom kursens olika delar samt att studenten i olika grad kan sammanlänka, resonera kring och tillämpa sina kunskaper för att förklara allt mer komplexa biokemiska frågor (examineras på skriftlig tentamen 5,0 hp).
- För högre betyg krävs gradvis fler poäng på tentamens A-D-frågor (examineras på skriftlig tentamen 5,0 hp).
Möjlighet till komplettering
Möjlighet till komplettering till betyget E erbjuds de studenter som får betyget Fx på examinationen.
Möjlighet till plussning
Det finns möjlighet för plussning på denna kurs. Detta görs genom att anmäla sig och delta i den skriftliga tentan vid ett nytt tentatillfälle. För anmälan krävs kontakt med kursexpeditionen i AlbaNova innan den ordinarie anmälningstiden har gått ut.
Etiskt förhållningssätt
- Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
- Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
- Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Ytterligare Information
Ändringar inför denna kursomgång
Föreläsningar
Nuvarande kursansvarig tog över kursen 2020 och inför 2021 har kursens upplägg förändrats på flera sätt. Antalet lärare har reducerats och Covid-anpassningen har lett till att den pedagogiska modellen på föreläsningarna har ändrats till omvänt klassrum (flipped classroom) med i förväg inspelade föreläsningar följt av schemalagda online föreläsningar där materialet diskuteras.
Ny kursbok
Kursens innehåll har reviderats sedan förra kurstillfället vårterminen 2020. Kursboken har bytts för att bättre täcka in den grundläggande biokemin.
Övningar
Kursen innehåller nu sex stycken övningar i halvklass. De fem första ligger under den första halvan av kursen och den sista i slutet av kursen. Övningarna behandlar viktiga biokemiska grunder och den sista behandlar problemlösning. Att kursen borde innehålla fler moment än enbart föreläsningar är något som många tidigare studenter har efterfrågat i kursutvärderingen.
Kontrollskrivning
Kursen innehåller nu en kontrollskrivning efter halva tiden. Kontrollskrivning är något som många tidigare studenter har efterfrågat i kursutvärderingen.
Kontakter
Kommunikation i kursen
Frågor kan närsomhelst under kursens gång ställas på diskussionsforumet i Canvas där lärarna svarar. Alternativt kan lärarna mejlas privat men de kommer då att avidentifiera och lägga ut frågan med svaret i forumet så att alla kursdeltagare kan se.
Innan kursen kan kursansvarig kontaktas via e-post.
Kursansvarig
Lärare
Examinator
Övriga kontakter
Studentexpeditionen på AlbaNova
Studentexpeditionen ligger i AlbaNovas huvudbyggnad på plan 5 i korridoren mittemot salarna FB53 och FB54 (ovanpå kurslabbet).
Fakta om kursomgång
Startdatum
Obligatoriskt innehåll saknas
Kursomgång
- VT 2021-60148
Undervisningsspråk
Svenska
Kursen ges av
Kontakter
Kommunikation i kursen
Frågor kan närsomhelst under kursens gång ställas på diskussionsforumet i Canvas där lärarna svarar. Alternativt kan lärarna mejlas privat men de kommer då att avidentifiera och lägga ut frågan med svaret i forumet så att alla kursdeltagare kan se.
Innan kursen kan kursansvarig kontaktas via e-post.
Kursansvarig
Lärare
Examinator
Övriga kontakter
Studentexpeditionen på AlbaNova
Studentexpeditionen ligger i AlbaNovas huvudbyggnad på plan 5 i korridoren mittemot salarna FB53 och FB54 (ovanpå kurslabbet).