In English

SK2500 Bildfysik med inriktning mot biomedicinsk mikroskopi 6,0 hp

Physics of Biomedical Microscopy

Kursen behandlar fysik och teknologi för mikroskopiska avbildningsmetoder, särskilt med inriktning mot biomedicinska tillämpningar.

  • Utbildningsnivå

    Avancerad nivå

  • Kursnivå (A-D)

    D

  • Huvudområde

  • Betygsskala

    A, B, C, D, E, FX, F

Kurstillfällen/kursomgångar

HT12 för programstuderande

HT13 SWB för programstuderande

  • Perioder

    HT13 P2 (6,0 hp)

  • Anmälningskod

    50457

  • Kursen startar

    2013-11-04

  • Kursen slutar

    2014 vecka: 3

  • Undervisningsspråk

    Engelska

  • Campus

    AlbaNova

  • Antal föreläsningar

    28 (preliminärt)

  • Antal övningar

  • Undervisningstid

    Dagtid

  • Undervisningsform

    Normal

  • Antal platser

    Ingen begränsning

  • Schema

    Schema (nytt fönster)

  • Kursansvarig

    Kjell S Carlsson <kjellc@kth.se>

  • Målgrupp

    Only for students within the SWB course package "Biomedical Physics".

HT13 för programstuderande

Lärandemål

Efter avslutad kurs ska studenten kunna:

  • ställa in belysningen för att få optimala prestanda i transmissionsmikroskopi.
  • välja lämplig ljuskälla och optiska filter, samt korrekt ställa in belysningen för fluorescensmikroskopi
  • välja lämplig objektivtyp (korrektionsgrad, immersion mm) för olika mikroskopiska undersökningar
  • välja lämplig kontrastmetod (faskontrast, DIC, fluorescens, mörkfält mm) och korrekt kunna utnyttja denna för att få en god bildkvalitet
  • beräkna vilken bildkvalitet som kan förväntas vad gäller t.ex. upplösningsförmåga och signal/brusförhållande i olika praktiska situationer
  • förstå och redogöra för de fysikaliska begränsningarna för mikroskopets prestanda vad gäller upplösningsförmåga och signal/brusförhållande
  • beskriva prestanda för olika mikroskoptyper genom att använda (och i vissa enkla fall beräkna) optiska överföringsfunktioner
  • välja lämplig samplingstäthet för digital bildregistrering i mikroskopi
  • datorbearbeta mikroskopibilder för att åskådliggöra tredimensionella strukturer
  • utföra kvantitativa mätningar i mikroskopibilder med hjälp av dator.

Kursens huvudsakliga innehåll

Grundläggande optik i ljusmikroskopet. Optiska avbildningsfel. Objektivtyper. Förstoringsgrad. Numerisk apertur. Mikroskopfotometri. Detektorer. Brus. Kontrastmetoder (fluorescens, faskontrast, DIC). Upplösningsförmåga. Fouriermetoder. Optiska överföringsfunktioner. Tredimensionell mikroskopiavbildning. Sampling och rekonstruktion av bilddata. Konfokal mikroskopi. En liten orientering om elektronmikroskopi, tunnel- och atomkraftsmikroskopi, optisk närfältsmikroskopi och röntgenmikroskopi.

Behörighet

Rekommenderade förkunskaper: Grundläggande vågrörelselära, geometrisk optik och fotometri motsvarande SK1100, (Fysik grundkurs del II, 9 hp). Elementära kunskaper om Fouriertransformer.

Litteratur

Carlsson, K. Imaging Physics, KTH.

Carlsson, K. Light Microscopy, KTH.

Laborationsinstruktioner.

Examination

  • LAB1 - Laborationskurs, 2,0 hp, betygsskala: P, F
  • TEN1 - Tentamen, 4,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Krav för slutbetyg

Kursen examineras genom skriftlig tentamen (TEN1; 4 hp, betygsskala A/B/C/D/E/Fx/F), samt godkända laborationer (LAB1; 2 hp, betygsskala P/F).

Ges av

SCI/Tillämpad fysik grundutbildning

Examinator

Kjell S Carlsson <kjellc@kth.se>

Versionsinformation

Kursplan giltig från och med HT08.
Examinationsinformation giltig från och med HT07.