CM2006 Medicinsk visualisering 6,0 hp

Välj termin och kursomgång
Välj termin och kursomgång för att se aktuell information och mer om kursen, såsom kursplan, studieperiod och anmälningsinformation.
Innehåll och lärandemål
Kursinnehåll
- Tillämpningar inom medicinsk visualisering
- Visualiseringspipeline
- Ytrekonstruktion och -rendering
- Volymrendering
- Volyminteraktion
- Stereoskopiska tekniker
Kursen består av föreläsningar, laborationer och matematiska övningar. Deltagarna ska kombinera VTK (Visualization Toolkit) i Python med andra bibliotek. Kursen innehåller också introduktionslabbar för studenter med programmeringserfarenhet men utan erfarenhet i Python.
Lärandemål
Medicinsk visualisering är ett specifikt område inom vetenskaplig visualisering som är inriktat på medicinska tillämpningar. Visualisering i ett medicinskt sammanhang används för olika ändamål, bl. a. diagnos med radiologiska data, behandlingsplanering, intraoperativt stöd, dataannotering och utbildning.
Kursen omfattar de begrepp, teorier och mest använda metoder som används för att utforska och interagera med bilder i medicinska tillämpningar. Efter avslutad kurs kommer deltagaren att kunna:
Förstå de olika delarna av en visualiseringspipeline
Förstå teorin för de mest använda metoderna för yt- och volymrendering
Sammanfatta de mest använda teknikerna i volyminteraktion och stereoåtergivning
Utforma visualiseringslösningar för medicinska tillämpningar
Välj och anpassa de lämpligaste metoderna för visualisering i medicinska tillämpningar
Använd avancerade verktyg för att skapa visualiseringsprototyper med hjälp av medicinska bilder som kan användas i medicinska tillämpningar
för att:
förstå en komplett visualiseringspipeline i ett medicinskt sammanhang
kunna implementera visualiseringslösningar i medicinska tillämpningar
ha en bred kunskapsbas som kan underlätta förstående av litteratur inom området
Kursupplägg
Kurslitteratur och förberedelser
Särskild behörighet
Kandidateexamen i medicinsk teknik, teknisk fysik, elektroteknik, datavetenskap eller motsvarande. Engelska B/6
Rekommenderade förkunskaper
Kurser I programmering i Python eller MATLAB.
Utrustning
Kurslitteratur
Den föreslagna textboken är:
1. Bernhard Preim and Charl Botha. Visual Computing for Medicine, Theory, Algorithms and Applications 2nd Ed. Morgan Kaufman. 2014
Ytterligare litteratur:
2. Alexandru C Telea. Data Visualization: Principles and Practice 2nd Ed. CRC Press. 2015
3. Will Schroeder, Ken Martin, Bill Lorensen. The Visualization Toolkit: An Object-Oriented Approach To 3D Graphics 4th Ed. Kitware Inc. 2006 (available online)
4. The VTK User’s Guide 11th Ed. Kitware Inc. 2010 (available online)
Examination och slutförande
När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.
Betygsskala
Examination
- PRO1 - Projekt, 6,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
Övriga krav för slutbetyg
Godkänd projektuppgift samt närvaro på minst 90% av kursaktiviteterna.
Möjlighet till komplettering
Möjlighet till plussning
Examinator
Etiskt förhållningssätt
- Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
- Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
- Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Ytterligare information
Kurswebb
Ytterligare information om kursen kan hittas på kurswebben via länken nedan. Information på kurswebben kommer framöver flyttas till denna sida.
Kurswebb CM2006