Kursen innehåller 12 timmar föreläsningar, 3 timmar seminarier och 14 timmar praktiskt arbete med följande moment: bildtagning, provberedning, bildbearbetning, självstudier av litteratur/utdelat material, hemuppgift samt en muntlig presentation av hemuppgiften.
FCH3302 Kryo-elektronmikroskopi för avbildning och analys av biologiskt material 5,0 hp
Kursen täcker provberedning och avbildning av biologiskt material med kryoelektronmikroskopi (kryoEM). I kursen förklaras grunderna för bildgivning och bildbearbetning för transmisionselektronmikroskopi. Kursen är en teoretisk och praktisk introduktion till kryoEM-tekniken. Målet är att deltagarna skall bekanta sig med arbetsflödet i ett kryoEMprojekt, inklusive bildprocessning, för att erhålla en 3Drekonstruktion. Nackdelar med tekniken diskuteras också för att uppmärksamma de begränsningar tekniken har.
Information per kursomgång
Kursomgångar saknas för aktuella eller kommande terminer.
Kursplan som PDF
Notera: all information från kursplanen visas i tillgängligt format på denna sida.
Kursplan FCH3302 (VT 2021–)Rubriker med innehåll från kursplan FCH3302 (VT 2021–) är markerade med en asterisk ( )
Innehåll och lärandemål
Kursupplägg
Kursinnehåll
Kursen ska förse deltagarna med grundläggande principer för:
- Transmissionselektronmikroskopi och dess bildgivning
- Provberedning för kryoEM, material och kringutrustning
- Grunderna för och olika mjukvara för bildbearbetning and 3D- rekonstruktion.
Lärandemål
Efter avslutad kurs ska doktoranden ha kunskap och förmåga att:
- Förklara de grundläggande principerna i kryoEM för hur bilderna genereras och bilderna bearbetas
- Demonstrera adekvat kunskap för att planera och utföra olika typer av provberedning för kryoEM
- Föreslå, planera och implementera en strategi för ett eget projekt lämpligt för kryoEM.
- Kritiskt reflektera över de risker och miljöaspekter provberedningen innebär för dig själv, kollegor och samhället.
- Presentera studier av relevant litteratur och hur de kan förbättra din egen forskning.
Kurslitteratur och förberedelser
Särskild behörighet
Ingen information tillagd
Kurslitteratur
Du hittar information om kurslitteratur antingen i kursomgångens kurs-PM eller i kursomgångens kursrum i Canvas.
Examination och slutförande
Betygsskala
P, F
Examination
- SEM1 - Seminarier, 2,0 hp, betygsskala: P, F
- LAB1 - Laborationer, 3,0 hp, betygsskala: P, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.
Närvaro vid seminarierna och en godkänd 15 min muntlig presentation samt laborationer i grupp och skriftlig uppgift på föreslaget projekt.
Examinator
Etiskt förhållningssätt
- Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
- Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
- Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Ytterligare information
Kursrum i Canvas
Registrerade studenter hittar information för genomförande av kursen i kursrummet i Canvas. En länk till kursrummet finns under fliken Studier i Personliga menyn vid kursstart.
Ges av
Utbildningsnivå
Forskarnivå