Hoppa till huvudinnehållet
Till KTH:s startsida Till KTH:s startsida

HL2007 Matematiska metoder för 3D-mikroskopi 7,5 hp

Administrera Om kursen

Kursomgångar saknas för aktuella eller kommande terminer.
Rubriker med innehåll från kursplan HL2007 (HT 2007–) är markerade med en asterisk ( )

Innehåll och lärandemål

Kursinnehåll

  • Fourier analysis
  • Sampling theory
  • 3D-reconstruction
  • Radon transform
  • Central section theorem
  • Image restoration
  • Transfer theory
  • Correlation
  • Convolution
  • Multivariate statistics

Lärandemål

The main purpose is to introduce basic mathematical methods used in tomography, electron and light microscopy of other forms of biomedical imaging.

After completion of the course the student should:

  • Understand Fourier analysis in 2 and 3 dimensions
  • Understand the concepts and use of convolution and correlation in 2 and 3 dimensions
  • Understand and be able to apply the convolution and the correlation theorem
  • Be able to build the Fourier transform of a composite function from the Fourier transforms of its component functions
  • Understand and be able to derive the central section theorem
  • Understand the concept of pointspread functions and transfer functions and their correction
  • Understand sampling theory and the methods of alignment in 2 and 3 dimensions
  • Understand multivariate statistical methods as applied to images

Kurslitteratur och förberedelser

Särskild behörighet

Bachelor’s degree in Engineering physics, Electrical Engineering, Computer Science or equivalent. Basic knowledge of anatomy.

Rekommenderade förkunskaper

Ingen information tillagd

Utrustning

Ingen information tillagd

Kurslitteratur

Bracewell, Ronald N., Fourier Analysis and Imaging, Academic/Plenum Publishers 2004, ISBN-10: 0306481871
Koeck, Philip J. B., Introduction to Biophysical Electron Microscopy (compendium)

Examination och slutförande

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

Betygsskala

A, B, C, D, E, FX, F

Examination

  • LAB1 - Laborationer, 1,5 hp, betygsskala: P, F
  • TEN1 - Tentamen, 6,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Övriga krav för slutbetyg

Passed written exam (TEN1; 6 cr.) grading A-F.
Passed lab works (LAB1; 1.5 cr.) grading P/F.

Möjlighet till komplettering

Ingen information tillagd

Möjlighet till plussning

Ingen information tillagd

Examinator

Profile picture Philip Köck

Etiskt förhållningssätt

  • Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
  • Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
  • Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ytterligare information

Kursrum i Canvas

Registrerade studenter hittar information för genomförande av kursen i kursrummet i Canvas. En länk till kursrummet finns under fliken Studier i Personliga menyn vid kursstart.

Ges av

CBH/Medicinteknik och hälsosystem

Huvudområde

Fysik

Utbildningsnivå

Avancerad nivå

Påbyggnad

Ingen information tillagd

Kontaktperson

Philip Koeck, koeck@kth.se

Övrig information

Observera att exakt start- och slutdatum för kursen ännu inte är fastställt utan kan komma att ändras.