CB2442 Bioinformatik 7,5 hp

Teori och metoder för: parvis alignment av DNA/RNA- och proteinsekvenser; multipel sekvensalignment; analys av DNA/RNA- och proteinsekvensmotiv; fylogenetisk analys; genexpressionsanalys. Publika databaser och verktyg. Programmering av grundläggande bioinformatiska algoritmer.

Efter att ha blivit godkänd på kursen ska studenten kunna:

• förklara grundläggande bioinformatiska metoder
• redogöra för tillämpningar och begränsningar av bioinformatiska metoder
• använda relevanta metoder för att analysera bioinformatiska problem
• tolka resultat av bioinformatiska analyser
• programmera grundläggande bioinformatiska algoritmer

Minst 150 högskolepoäng från årskurs 1, 2 och 3 varav minst 100 högskolepoäng från årskurs 1 och 2 samt kandidatexamensarbete måste vara avklarade. I de 150 poängen skall ingå avklarade kurser motsvarande minst 20 hp matematik, numeriska metoder, data, varav minst 5 hp utgörs av numeriska metoder och data, samt minst 15 hp totalt inom bioteknik, biokemi, och/eller molekylärbiologi.

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

• LAB1 - Datorlaboration, 2,5 hp, betygsskala: P, F
• TEN1 - Skriftlig tentamen, 5,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Lukas Käll

• Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
• Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
• Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ersätter BB2441 Bioinformatik