CB2442 Bioinformatik 7,5 hp

Teori och metoder för: parvis alignment av DNA/RNA- och proteinsekvenser; multipel sekvensalignment; analys av DNA/RNA- och proteinsekvensmotiv; fylogenetisk analys; genexpressionsanalys. Publika databaser och verktyg. Programmering av grundläggande bioinformatiska algoritmer.

Efter att ha blivit godkänd på kursen ska studenten kunna:

• förklara grundläggande bioinformatiska metoder
• redogöra för tillämpningar och begränsningar av bioinformatiska metoder
• använda relevanta metoder för att analysera bioinformatiska problem
• tolka resultat av bioinformatiska analyser
• programmera grundläggande bioinformatiska algoritmer

Minst 150 högskolepoäng från årskurs 1, 2 och 3 varav minst 100 högskolepoäng från årskurs 1 och 2 samt kandidatexamensarbete måste vara avklarade. I de 150 poängen skall ingå avklarade kurser motsvarande minst 20 hp matematik, numeriska metoder, data, varav minst 5 hp utgörs av numeriska metoder och data, samt minst 15 hp totalt inom bioteknik, biokemi, och/eller molekylärbiologi.

När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.

• LAB1 - Datorlaboration, 2,5 hp, betygsskala: P, F
• TEN1 - Skriftlig tentamen, 5,0 hp, betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Olof Emanuelsson

• Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
• Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
• Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ytterligare information om kursen kan hittas på kurswebben via länken nedan. Information på kurswebben kommer framöver flyttas till denna sida.