FCK3312 NMR-spektroskopi och -avbildning – kvantmekaniska principer 4,5 hp
Kursen behandlar teori och praktik för multidimensionell NMRspektroskopi
Information för forskarstuderande om när kursen ges
Kursen ges enligt överenskommelse, kontakta kursansvarig för information.
Innehåll och lärandemål
Kursupplägg
Kursen omfattar cirka 100 heltidsstudietimmar varav 30 timmar föreläsningar på Zoom utöver självstudier. Föreläsningarna behandlar grundläggande principer inkl. spinnalgebra, täthetsoperatorsformalismen av kvant-statistisk mekanik, och uppbyggnad och operation av vanliga pulssekvenser för multidimensionell NMR. Kursen innefattar en genomgång av hur dessa metoder i kombination används i strukturbiokemi.
För deltagare utan tillräckliga kvantmekaniska grunder, erbjuds det en kort och frivillig föreläsnings- och konsultationsserie ”Quantum mechanics for pedestrians” som möjliggör att studenter kan ta till sig kursens material.
Kursinnehåll
- En spinn i magnetfält
- Täthetsoperatorformalismen
- Kärnspinnsinteraktioner och deras effekt
- Polarizationsövereföring
- 2D COSY och HSQC experiment
- Dipol-dipol relaxation och NOE effekten
- 2D NOESY experiment
- Grundläggande NMR strategier för biomolekyler
Lärandemål
Efter fullgjord kurs ska studenten kunna:
förklara de kvantmekaniska principerna for NMR-spektroskopi
förklara operationen av de vanligaste multidimensionell NMR-experiment
förklara hur lämpliga kombinationer av NMR-experiment kan användas för strukturbestämning av biomolekyler
utnyttja ovanstående kunskaper för att planera, utföra och utvärdera ett laborationsprojekt i grupp (eller individuellt, beroende bl a på antalet deltagare), inklusive utföra en litteraturstudie, presentera laborationsprojektet i en skriftlig rapport, samt opponera på ett annat laborationsprojekt i kursen
Kurslitteratur och förberedelser
Särskild behörighet
Kunskaper motsvarande kurs FCK3311, NMR-spektroskopi och –avbildning – grundläggande principer, eller motsvarande.
Rekommenderade förkunskaper
Utrustning
Kurslitteratur
Understanding NMR Spectroscopy, J. Keeler, 2nd ed,
Utdelat material
Examination och slutförande
När kurs inte längre ges har student möjlighet att examineras under ytterligare två läsår.
Betygsskala
Examination
- LAB1 - Laborationsprojekt, 1,5 hp, betygsskala: P, F
- RAP1 - Rapport, 3,0 hp, betygsskala: P, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
Godkänd rapport (RAP1; 3 hp)
Godkänd skriftlig och muntlig redovisning av projektlaborationen (LAB1; 1,5 hp)
Övriga krav för slutbetyg
Studenten ska uppfylla alla delar av alla lärandemålen på både en grundläggande och en detaljerad nivå, och med både bredd och djup. Studenten ska kunna använda kunskapen för att sätta upp multidimensionella NMR-experiment för utvalda problem, och relatera detta till sin egen forskning.
Möjlighet till komplettering
Möjlighet till plussning
Examinator
Etiskt förhållningssätt
- Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
- Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
- Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Ytterligare information
Kursrum i Canvas
Ges av
Huvudområde
Utbildningsnivå
Påbyggnad
Övrig information
Max 30 deltagare. Kursen utförs i viss omfattnig på distans via Zoom, föreläsningarna (dock inte laborationen) förblir öppna för andra deltagare.