Kursen biokemi 1 beskriver livets grundläggande makromolekylära byggstenar proteiner, lipider och kolhydrater samt deras samverkan i de basala metaboliska reaktionsvägarna. Vi studerar främst nedbrytande reaktioner för cellens energiutvinning på denna kurs.
Kurs-PM HT 2022
Presentation av kursen
Rubriker markerade med en asterisk ( * ) kommer från kursplan version HT 2022
Innehåll och lärandemål
Kursinnehåll
Alla levande organismer kräver energi, men möjligheten att erhålla energi varierar. Denna process kallas ämnesomsättning och ger oss både biologiska byggstenar och energi. Ämnesomsättningen omfattar både nedbrytande (katabolism) och uppbyggande (anabolism) processer som tillsammans utgör metabolismen. Denna kurs kommer huvudsakligen behandla nedbrytande processer av kolhydrater för energiutvinning samt dess relevanta biomolekyler.
Kursens huvudsakliga innehåll:
- Kemiska strukturer, funktionella grupper, isomeri och olika typer av bindningar
- Vattens unika lösningsmedelsegenskaper
- Biologiska byggstenar; aminosyror, nukleotider, kolhydrater och lipider
- Visualisering av enklare biokemiska strukturer för hand
- Proteiners uppbyggnad, struktur och funktion
- Enzymers aktivitet, katalytiska strategier och roll i metabolismen
- Kolhydraters struktur, isomeri och uppbyggnad från mono- till polysackarider
- Olika typer av lipider
- Uppbyggnad av biologiska membraner med proteiner, kanaler och pumpar
- Kolhydratnedbrytande metabolism från glykolys till oxidativ fosforylering
- Energiförändringar och elektronöverföringar i metabolismen
- Enzymers roll och bidrag i utvecklingen av ett hållbart samhälle
- Biokemins roll i ett hållbart samhälle
- Utförande av ett laborationsmoment med hänsyn till miljö, människa och samhälle samt sammanställning av en laborationsrapport
- Riskanalys av laborationens ingående kemikaliers miljöpåverkan samt värdering av hur dessa bör hanteras på laboratoriet
Lärandemål
Efter godkänd kurs (betyg E) skall studenten uppvisa
Kunskap och förståelse genom att kunna:
- Beskriva och förklara grundläggande biokemiska begrepp. (TEN1)
- Beskriva olika biomolekylers kemiska namn, funktion och kemiska struktur. (TEN1)
- Tillämpa vanliga metoder inom biokemisk laborationsteknik, där hänsyn tas till miljö, människa och samhälle. (LAB1)
Färdigheter och förmågor genom att kunna:
- Sammanfatta de utförda laborationerna i en rapport. (LAB1)
För högre betyg (A-D) ska studenten även uppvisa
Kunskap och förståelse genom att kunna:
- Använda och kombinera sina kunskaper inom biokemi för att förklara komplexa biokemiska frågeställningar. (TEN1)
Läraktiviteter
Föreläsningar/Workshoppar
Under kursen ges totalt 12 föreläsningar som täcker in det mesta av kursens teoretiska innehåll. De flesta föreläsningarna består av förinspelade videos som man tittar på innan varje schemalagt tillfälle och lämnar in en reflektionsuppgift. De flesta schemalagda föreläsningarna är workshoppar där vi jobbar med materialet och diskuterar frågor och detta kräver att man har tittat på föreläsningen på egen hand innan.
Reflektionsuppgifter
Innan respektive schemalagda föreläsnings/workshop-tillfälle tittar man på det inspelade materialet och lämnar in en reflektionsuppgift enligt deadline på Canvas. Vissa föreläsningar kan ta upp till två timmar att titta igenom.
Övningar
Kursen innehåller sex stycken övningar i halvklass i sal där vi arbetar med frågor kopplade till det teoretiska materialet. Det är mycket bra att ha en egen molekylbyggsats för att övningarna ska bli effektiva. På den andra halvan av kursen använder vi quiz i bokens lärplattform Achieve. Dessa quiz fungerar som fyra ytterligare övningar på kursen.
Kontrollskrivning
Kursen innehåller en schemalagd kontrollskrivning efter halva kursen. Den görs digitalt i Canvas på utsatt tid med Zoom-närvaro och omfattar innehållet på föreläsningarna 1-6 samt övningarna 1-5. Kontrollskrivningen är obligatorisk och ingår i kursens examination.
Laborationer
Kursen innehåller två laborationer som examineras via en laborationsrapport. Här ingår att göra en riskanalys, beskriva hur olika kemikalier hanteras på laboratoriet samt hur avfall som uppstår skall hanteras. Efter avslutat laborationsmoment skrivs en laborationsrapport tillsammans med din laborationsgrupp.
Detaljplanering
Läraktivitet | Innehåll | Förberedelse |
---|---|---|
Föreläsning 1 | Kursintroduktion | Boken kapitel 1, kurs PM |
Övning 1 | Kemisk bindning, kemisk struktur och funktionella grupper | Boken kapitel 1: sid 23-24 |
Föreläsning 2 | Aminosyror och proteinstruktur | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 2 |
Övning 2 | Aminosyror och peptider | Boken kapitel 2 |
Föreläsning 3 | Enzymer | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 8 (ej sid 254-255) |
Föreläsning 4 | Enzymers katalytiska strategier | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 9 (ej 9.3 & 9.4) och 15.4 |
Övning 3 | Nyckelreaktioner och koenzymer i metabolismen | Föreläsning 3 & 4 |
Föreläsning 5 | Lipider och biologiska membran | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 12 |
Övning 4 | Lipider | Föreläsning 5 |
Föreläsning 6 | Kolhydrater | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 11 (ej sid 355-364) |
Övning 5 | Kolhydrater | Föreläsning 6 |
Föreläsning 7 | Membraners kanaler, pumpar och bärare | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 13 (ej 13.4 & 13.5) |
Föreläsning 8 | Metabolism-introduktion & glykolysen | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 15-15.3 & 16-16.2 |
Föreläsning 9 | Glukoneogenesen & glykogennedbrytning | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 16.3-16.4 & 21 (ej 21.4 & 21.5) |
Föreläsning 10 | Citronsyracykeln | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 17 (ej sid 544-548, ej 17.5) |
Föreläsning 11 | Elektrontransportkedjan | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 18 |
Föreläsning 12 | ATP syntes & kursavslut | Inspelat material, reflektionsuppgift och Boken kapitel 18 |
Övning 6 | Komplexa biokemiska uppgifter |
Kursens pedagogiska upplägg
På denna kurs använder vi ett effektivt lärande som delvis examineras kontiuerligt genom att man kan samla poäng under kursens gång på tre olika sätt:
Inför varje schemalagt föreläsningstillfälle förbereder man sig själv genom att titta igenom det förinspelade materialet och lämna in en reflektionsuppgift. En förinspelad föreläsning tar ibland upp till 2 timmar att titta igenom. Detta material kommer inte att gås igenom igen utan när vi ses på det schemalagda workshop-tillfället så jobbar vi istället med materialet och du behöver bidra aktivt med dina frågor och reflektioner. Varje inlämnad reflektion i tid enligt varje deadline som beskrivs i Canvas ger 0,2 poäng. Detta kan ge totalt 2,2 poäng.
Aktivt deltagande på kursens sex schemalagda övningar samt slutförande av de fyra quiz-övningarna ger 0,2 poäng per övning. Detta kan ge totalt 2,0 poäng.
Poängen på den obligatoriska kontrollskrivningen kan ge max 3,0 poäng.
Förberedelser inför kursstart
Kurslitteratur
Kursbok: Biochemistry, 9:e utgåvan (2019), Berg, Tymoczko, Gatto Jr. och Stryer. Boken är gratis som e-bok för alla kursregistrerade studenter. Den kan också köpas på Kårbokhandeln för den som vill ha en bok i pappersform. Övrig litteratur och material till kursen finns tillgängligt i lärplattformen Canvas.
Utrustning
Molekylmodellbyggsats: Vid flera av övningstillfällena kommer vi att bygga biomolekyler med hjälp av en molekylmodellbyggsats (för organisk kemi/biokemi). Ett visst antal molekylmodellbyggsatser kommer finnas tillgängliga på de schemalagda övningarna. En molekylmodellbyggsats är användbar under hela utbildningen och vi rekommenderar starkt att man köper en egen byggsats och tar med den till övningstillfällena. Det finns många olika typer men en låda för organisk kemi fungerar bra. På Kårbokhandeln på KTH finns en bra variant. Byggsatsen kan man också använda på kurserna i organisk kemi och man får ta med sin egen molekylbyggsatslåda till tentan.
Stöd för studenter med funktionsnedsättning
Om du har en funktionsnedsättning kan du få stöd via Funka:
Examination och slutförande
Betygsskala
A, B, C, D, E, FX, F
Examination
- LABA - Laboration, 1,0 hp, Betygsskala: P, F
- TENA - Skriftlig tentamen, 6,5 hp, Betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F
Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s samordnare för funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.
Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.
Avsnittet nedan kommer inte från kursplanen:
Laboration ( LABA )
Det laborativa momentet består av 2 laborationer samt 3 övningstillfällen. Laborationsmomentet gås igenom vid 2 övningstillfällen i halvklass där laborationsrutiner, riskanalys, kemikaliers miljöpåverkan, avfallshantering samt rapportskrivning gås igenom. Efter laboration 2 ska en laborationsrapport skrivas. Denna kommer initialt att kamraträttas vid ett tredje övningstillfälle för att ge möjlighet till återkoppling innan inlämning. Labrapporten ligger till grund för examination av det laborativa momentet. Mer information om
laborationsmomentet finns i Laborationskompendiet.
Skriftlig tentamen ( TENA )
Teoridelen examineras på en skriftlig salstentamen (TENA). Enda tillåtna hjälpmedel är molekylmodellbyggsatsen som du får ta med dig om du vill. Tentan består av olika avsnitt. För varje avsnitt finns frågor för betyget E och frågor för betygen A-D. Frågorna för betyg E är av mer grundläggande karaktär och täcker basala begrepp inom kursen. Frågorna för betygen A-D bygger mer på detaljkunskap, förståelse, sammanlänkning av moment och värdering av biokemiska begrepp. E-betygsfrågorna utgör 30 p och frågorna för högre betyg ytterligare 30 p.
Möjlighet till bonuspoäng
Poäng till tentamen kan erhållas på tre sätt. (1) Den obligatoriska kontrollskrivningen på grundläggande begrepp ger möjlighet att få upp till tre poäng. (2) Som förberedelse till varje föreläsnings workshop inlämnas en reflektionsuppgift i Canvas. Detta ger totalt 2,2 poäng. (3) Aktivt deltagande på övningarna ger totalt två poäng. Dessa poäng (totalt max 7,2 poäng) adderas till ditt resultat på tentan och kan bidra till att du klarar E-betyget eller göra att tentabetyget höjs ett steg.
Övriga krav för slutbetyg
För godkänt i kursen krävs godkänd tentamen (TENA) och godkänd laborationskurs (LABA)
Möjlighet till komplettering
Möjlighet till komplettering till betyget E erbjuds de studenter som får betyget Fx på examinationen.
Möjlighet till plussning
Det finns möjlighet för plussning på denna kurs. Detta görs genom att anmäla sig och delta i den skriftliga tentan vid ett nytt tentatillfälle. För anmälan krävs kontakt med kursexpeditionen i AlbaNova innan den ordinarie anmälningstiden har gått ut.
Etiskt förhållningssätt
- Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
- Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
- Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.
Ytterligare Information
Ingen information tillagd
Kontakter
Kursansvarig
Lärare
Lärarassistenter
Examinator
Övriga kontakter
Studentexpeditionen på AlbaNova
Studentexpeditionen ligger i AlbaNovas huvudbyggnad på plan 5 nära rotundan vid huvudentrén Roslagstullsbacken 21. studentexpedition@biotech.kth.se
Fakta om kursomgång
Startdatum
Obligatoriskt innehåll saknas
Kursomgång
- CBIOT HT 2022-50951
Undervisningsspråk
Svenska
Kursen ges av
Kontakter
Kursansvarig
Lärare
Lärarassistenter
Examinator
Övriga kontakter
Studentexpeditionen på AlbaNova
Studentexpeditionen ligger i AlbaNovas huvudbyggnad på plan 5 nära rotundan vid huvudentrén Roslagstullsbacken 21. studentexpedition@biotech.kth.se