Hoppa till huvudinnehållet
Till KTH:s startsida Till KTH:s startsida

BB1150 Biokemi 1 7,5 hp

Kurs-PM HT 2023-51724

Version 2 – 2023-08-23 18:04:40

Kursomgång

CBIOT (Startdatum 2023-08-28, Svenska)

Undervisningsspråk

Svenska

Kursen ges av

CBH/Industriell bioteknologi

Kurs-PM HT 2023

Presentation av kursen

Kursen biokemi 1 beskriver livets grundläggande makromolekylära byggstenar proteiner, lipider och kolhydrater samt deras samverkan i de basala metaboliska reaktionsvägarna. Vi studerar främst nedbrytande reaktioner för cellens energiutvinning på denna kurs.

Rubriker markerade med en asterisk ( * ) kommer från kursplan version VT 2023

Innehåll och lärandemål

Kursinnehåll

Alla levande organismer kräver energi, men möjligheten att erhålla energi varierar. Denna process kallas ämnesomsättning och ger både biologiska byggstenar och energi. Denna kurs behandlar huvudsakligen nedbrytande processer av kolhydrater för energiutvinning samt de centrala biomolekylerna och dess byggstenar aminosyror, lipider och kolhydrater.

Kursens huvudsakliga innehåll:

  • Rita kemiska strukturer, funktionella grupper, isomeri och olika typer av bindningar
  • Biologiska byggstenar; aminosyror, nukleotider, kolhydrater och lipider
  • Proteiners uppbyggnad, struktur och funktion
  • Enzymers aktivitet, katalytiska strategier och roll i metabolismen
  • Kolhydraters struktur, isomeri och uppbyggnad från mono- till polysackarider
  • Olika typer av lipider och uppbyggnad av biologiska membraner
  • Transport över membran
  • Kolhydratnedbrytande metabolism från glykolys till oxidativ fosforylering
  • Energiförändringar och elektronöverföringar i metabolismen
  • Utförande av ett laborationsmoment samt sammanställning av en laborationsrapport
  • Riskanalys av laborationens ingående kemikaliers miljöpåverkan samt värdering av hur dessa bör hanteras på laboratoriet

Lärandemål

Efter godkänd kurs (betyg E) skall studenten uppvisa

Kunskap och förståelse genom att kunna:

  • Beskriva och förklara grundläggande biokemiska begrepp. 
  • Beskriva olika biomolekylers kemiska namn, funktion och kemiska struktur. 
  • Tillämpa vanliga metoder inom biokemisk laborationsteknik.

Färdigheter och förmågor genom att kunna:

  • Sammanfatta de utförda laborationerna i en rapport. 

För högre betyg (A-D) ska studenten även uppvisa

Kunskap och förståelse genom att kunna:

  • Använda och kombinera sina kunskaper inom biokemi för att förklara komplexa biokemiska frågeställningar.

Läraktiviteter

Föreläsningar/Workshoppar​​

Under kursen ges totalt 12 föreläsningar som täcker in det mesta av kursens teoretiska innehåll. De flesta föreläsningarna består av förinspelade videos som man tittar på innan varje schemalagt tillfälle och lämnar in en reflektionsuppgift​. De flesta schemalagda föreläsningarna är workshoppar där vi jobbar med materialet från filmerna och diskuterar frågor och detta kräver att man har tittat på föreläsningen på egen hand innan den schemalagda workshopen. 

Reflektionsuppgifter

Innan varje schemalagd workshop tittar man på det inspelade materialet på egen hand och lämnar in en individuell reflektionsuppgift enligt deadline på Canvas. Vissa föreläsningar kan ta upp till två timmar att titta igenom. 

Övningar ​

Kursen innehåller sex stycken schemalagda övningar i halvklass i sal där vi arbetar med frågor kopplade till det teoretiska materialet. Det är mycket bra att ha en egen molekylbyggsats för att övningarna ska bli effektiva. På den andra halvan av kursen använder vi quiz i bokens lärplattform Achieve. Dessa quiz fungerar som fyra ytterligare övningar på kursen som man gör på egen hand. 

Kontrollskrivning

​Kursen innehåller en schemalagd kontrollskrivning efter halva kursen. Den görs digitalt i datasal och omfattar innehållet på föreläsningarna 1-6 samt övningarna 1-5​. Kontrollskrivningen är obligatorisk och ingår i kursens examination. Man måste ha 50% av poängen på kontrollskrivningen för att få godkänt. Muntlig omexamination med examinatorerna erbjuds vid underkänt resultat.

Laborationer

Kursen innehåller två laborationer som examineras via en laborationsrapport. Här ingår att göra en riskanalys, beskriva hur olika kemikalier hanteras på laboratoriet samt hur avfall som uppstår skall hanteras. Efter avslutat laborationsmoment skrivs en laborationsrapport tillsammans med din laborationsgrupp.

Detaljplanering

​​​Läraktivitet Innehåll Förberedelse
Föreläsning 1 Kursintroduktion Boken kapitel 1, kurs PM
Övning 1 Kemisk bindning, kemisk struktur och funktionella grupper Boken Chemistry Review Appendix: sid 1002-A4
Föreläsning 2 Aminosyror och proteinstruktur Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 2
Övning 2 Aminosyror och peptider Föreläsning 2
Föreläsning 3 Enzymer Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 5 (ej sid 166-168 The different types of reversible inhibitors are kinetically distinguishable​)
Föreläsning 4 Lipider och biologiska membran Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 12
Övning 3 Lipider Föreläsning 4
Föreläsning 5 Enzymers katalytiska strategier Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 6 (ej 6.4 & 6.5) och 15.4​​
Övning 4 Nyckelreaktioner och koenzymer i metabolismen Föreläsning 3 & 5
Föreläsning 6 Kolhydrater Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 11 (ej sid 340-348​)
Övning 5 Kolhydrater Föreläsning 6
Föreläsning 7 Membraners kanaler, pumpar och bärare Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel 13 (ej 13.4 & 13.5, men läs sid 395-398​ angående K+-kanalens jonselektivitet, text plus bilder 13.19-13.23)
Föreläsning 8 Metabolism-introduktion & glykolysen Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel ​15-15.3 & 16-16.3
Föreläsning 9 Glukoneogenesen & glykogennedbrytning Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel ​​16.4-16.5 & 21-21.4 
Föreläsning 10 Citronsyracykeln Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel​ 17-17.5 (ej sid 518-521 Mechanism: The synthesis of acetyl coenzyme A from pyruvate requires three enzymes and five ...)
Föreläsning 11 Elektrontransportkedjan Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel ​​18
Föreläsning 12 ATP syntes & kursavslut Inspelat material, reflektionsuppgift​ och Boken kapitel ​​18
Övning 10 Komplexa biokemiska uppgifter   

 

Kursens pedagogiska upplägg (Samla poäng till tentan)

​​​​På denna kurs använder vi ett effektivt lärande som delvis examineras kontiuerligt genom att man kan samla poäng under kursens gång på tre olika sätt:

Inför varje schemalagd föreläsningsworkshop förbereder man sig själv genom att titta igenom det förinspelade materialet och lämna in en reflektionsuppgift. En förinspelad föreläsning tar ibland upp till 2 timmar att titta igenom. Detta material kommer inte att gås igenom igen utan när vi ses på det schemalagda workshop-tillfället så jobbar vi istället med materialet och du behöver bidra aktivt med dina frågor och reflektioner. ​Varje inlämnad reflektion i tid enligt varje deadline som beskrivs i Canvas ger 0,2 poäng. ​Detta kan ge 2,2 poäng.

Aktivt deltagande på kursens sex schemalagda övningar samt slutförande av de fyra quiz-övningarna på andra halvan av kursen ger 0,2 poäng per övning. Detta kan ge 2,0 poäng.

Resultatet på den obligatoriska kontrollskrivningen ger poäng. Detta kan ge max 3,0 poäng.

Man kan alltså samla ihop totalt 7,2 poäng till tentan under kursens gång.

Förberedelser inför kursstart

Kurslitteratur

Kursbok: Biochemistry, 10:e utgåvan (2023), Berg, Gatto Jr., Hines, Tymoczko, och Stryer. Boken är gratis som e-bok för alla kursregistrerade studenter. Den kan också köpas på Kårbokhandeln för den som vill ha en bok i pappersform. Övrig litteratur och material till kursen finns tillgängligt i lärplattformen Canvas.

Vi använder Achieve på denna kurs. Achieve är en lärplattform från bokförlaget MacMillan där man kan göra quiz, träna på övningsfrågor och få tips på vilka avsnitt man bör läsa i boken. På första föreläsningen går vi igenom hur man skapar sitt konto på Achieve.

Utrustning

Molekylmodellbyggsats: Vid flera av övningstillfällena kommer vi att bygga biomolekyler med hjälp av en molekylmodellbyggsats (för organisk kemi/biokemi). Ett visst antal molekylmodellbyggsatser kommer finnas tillgängliga på de schemalagda övningarna att låna. En molekylmodellbyggsats är användbar under hela utbildningen och vi rekommenderar starkt att man köper en egen byggsats och tar med den till övningstillfällena. Det finns många olika typer men en låda för organisk kemi fungerar bra. På Kårbokhandeln på KTH finns en bra variant. Byggsatsen kan man också använda på kurserna i organisk kemi och man får ta med sin egen molekylbyggsatslåda till tentan i biokemi 1.

Examination och slutförande

Betygsskala

A, B, C, D, E, FX, F

Examination

  • LABA - Laboration, 1,0 hp, Betygsskala: P, F
  • TENA - Skriftlig tentamen, 6,5 hp, Betygsskala: A, B, C, D, E, FX, F

Examinator beslutar, baserat på rekommendation från KTH:s handläggare av stöd till studenter med funktionsnedsättning, om eventuell anpassad examination för studenter med dokumenterad, varaktig funktionsnedsättning.

Examinator får medge annan examinationsform vid omexamination av enstaka studenter.

Avsnittet nedan kommer inte från kursplanen:

​Laboration ( LABA )

Det laborativa momentet består av 2 laborationer samt 3 övningstillfällen. Laborationsmomentet gås igenom vid 2 övningstillfällen i halvklass där laborationsrutiner, riskanalys, kemikaliers miljöpåverkan, avfallshantering samt rapportskrivning gås igenom. Efter laboration 2 ska en laborationsrapport skrivas. Denna kommer initialt att kamraträttas vid ett tredje övningstillfälle för att ge möjlighet till återkoppling innan inlämning. Labrapporten ligger till grund för examination av det laborativa momentet. Mer information om laborationsmomentet finns i Laborationskompendiet.

Skriftlig tentamen ( TENA )

Teoridelen examineras på en skriftlig salstentamen (TENA) i datasal. Enda tillåtna hjälpmedel är molekylmodellbyggsatsen som du får ta med dig om du vill​. Tentan ​består både av quiz-frågor på dator och frågor som besvaras på papper. På tentan finns frågor för betyget E och andra frågor för betygen A-D. Frågorna för betyg E är av mer grundläggande karaktär och täcker basala begrepp inom kursen. Frågorna för betygen A-D bygger mer på detaljkunskap, förståelse, sammanlänkning av moment och värdering av biokemiska begrepp. E-betygsfrågorna utgör 30 p och frågorna för högre betyg ytterligare 30 p. Kontrollskrivningen i mitten av kursen är obligatorisk och ingår i den skriftliga examinationen.

Möjlighet att samla poäng ​

Extra poäng under kursen kan erhållas på tre sätt.​ (1) Den obligatoriska ​kontrollskrivningen på grundläggande begrepp ger möjlighet att få upp till tre poäng. (2) Som förberedelse till varje föreläsnings-workshop inlämnas en reflektionsuppgift i Canvas​. Detta ger totalt 2,2 poäng.​ (3) Aktivt deltagande på övningarna ger totalt 2 poäng. Dessa poäng (totalt max 7,2 poäng) ​adderas till ditt resultat på den skriftliga tentan och ​kan bidra till att du klarar E-betyget eller kan göra att tentabetyget höjs ett steg.​ 

Övriga krav för slutbetyg

För godkänt i kursen krävs godkänd tentamen (TENA) och godkänd laborationskurs (LABA)

Möjlighet till komplettering

Möjlighet till muntlig komplettering till betyget E erbjuds de studenter som får betyget Fx på examinationen.

Möjlighet till plussning

Det finns möjlighet för plussning på denna kurs. Detta görs genom att anmäla sig och delta i den skriftliga tentan vid ett nytt tentatillfälle. För anmälan krävs kontakt med studentsupport innan den ordinarie anmälningstiden har gått ut.

Etiskt förhållningssätt

  • Vid grupparbete har alla i gruppen ansvar för gruppens arbete.
  • Vid examination ska varje student ärligt redovisa hjälp som erhållits och källor som använts.
  • Vid muntlig examination ska varje student kunna redogöra för hela uppgiften och hela lösningen.

Ytterligare Information

Ingen information tillagd

Fakta om kursomgång

Startdatum

Obligatoriskt innehåll saknas

Kursomgång

  • CBIOT HT 2023-51724

Undervisningsspråk

Svenska

Kursen ges av

CBH/Industriell bioteknologi

Kontakter

Kursansvarig

Lärare

Lärarassistenter

Examinator

Övriga kontakter