Till KTH:s startsida Till KTH:s startsida

Nyhetsflöde

Logga in till din kurswebb

Du är inte inloggad på KTH så innehållet är inte anpassat efter dina val.

I Nyhetsflödet hittar du uppdateringar på sidor, schema och inlägg från lärare (när de även behöver nå tidigare registrerade studenter).

Februari 2012
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 17 februari 2012

The lab instructions can be found here:

http://www.nada.kth.se/~lukask/course/BB2490/practicals/mslab/

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 7 februari 2012

Here are the lab instructions for Lab3: LAB3_BB2490_DD2399_spring2012.pdf

Please note, deadline for report submission is Thursday 16 February at 17:00. Email your report to kristoffer.sahlin@scilifelab.se.

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 7 februari 2012

The MaxQuant article: goo.gl/vGhCI

MACS: Zhang_Genome Biol_9_R137_2008-1.pdf

Sicer: Zang_Bioinformatics_25_1952-8_2009.pdf

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 6 februari 2012

Slides at goo.gl/WG5T3

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 1 februari 2012

Here is the reading for Friday's lecture: Park_Nature Reviews Genetics_10_669-680_2009.pdf

kommenterade 3 februari 2012

Slides: F8.BB2490_DD2399.pdf

Articles for student presentations lecture 10:

MACS: Zhang_Genome Biol_9_R137_2008-1.pdf

Sicer: Zang_Bioinformatics_25_1952-8_2009.pdf

The MaxQuant paper will be added later.

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 1 februari 2012

Here are the lab instructions for Lab2: LAB2_BB2490_DD2399_spring2012.pdf

Please note, deadline for report submission is Thursday 9 February at 17:00. Email your report to kristoffer.sahlin@scilifelab.se.

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
Januari 2012
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 30 januari 2012

Slides at http://goo.gl/3cRu3

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
kommenterade 27 januari 2012

Slides: F6.BB2490_DD2399.pdf

Articles for lecture 8 (2012-02-03):

RPKM article: Mortazavi_Nat Meth_5_621-628_2008.pdf

CuffLinks article: Trapnell_Nat Biotechnol_28_511-5_2010.pdf

DEseq article: Anders_Genome Biol_11_R106_2010-1.pdf

kommenterade 27 januari 2012

The three articles stated so far are for the student presentations. As usual we will start with student presentations the first 45 minutes.

There will also be another article posted (on Monday at the latest), which everyone should read in order to prepare for the new topics introduced at the second half of lecture 8 (ChIP-seq).

Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012
 
under
VT 2012 TBSBM
Schemahandläggare skapade händelsen 4 januari 2012
Schemahandläggare ställde in händelsen 23 mars 2012