Gruppwebben som samarbetsyta stängs 31 december 2026. Du som administratör behöver nu exportera gruppens innehåll och/eller radera gruppen.
Observera: Från och med den 1 oktober 2026 kommer delar av gruppwebben som inte längre används, successivt att stängas ned, exempelvis gruppwebbar som redan har flyttats eller varit inaktiva under en längre tid.
Mer information hittar du i nyheten: Gruppwebben och Social stänger hösten 2026. Stöd och instruktioner för hur du exporterar en gruppwebb finns i: Gruppwebben som samarbetsyta stängs hösten 2026.
Lab 3
These assignments are meant to introduce you to both the pattern library "re" and "Biopython".
Notice!
The online documentation that you find at BioPython.org is for version 1.49, which was released late in the course. CSC has version 1.48 installed, and there are some changes which become apparent in this lab. The BioPython tutorial we link to is for the version you need!
There is an advanced assignment for Lab 3 on plotting.
Basic assignments
- Translate DNA
- Motif filter
- KLEEK aligned?
- Remote Blast
- Blast parsing.