Gruppwebben som samarbetsyta stängs 1 oktober 2026. Du som administratör behöver nu exportera gruppens innehåll och/eller radera gruppen.
Observera: Från och med den 1 oktober 2026 kommer delar av gruppwebben som inte längre används, successivt att stängas ned, exempelvis gruppwebbar som redan har flyttats eller varit inaktiva under en längre tid.
Mer information hittar du i nyheten: Gruppwebben och Social stänger den 1 oktober 2026. Stöd och instruktioner för hur du exporterar en gruppwebb finns i: Gruppwebben som samarbetsyta stängs 1 oktober 2026..
Docs and links
Required course reading
- Book: Haddock and Dunn, "Practical computing for Biologists"
- Paper: William Stafford Noble, "A quick guide to organising computational biology projects", PLoS Comp Biol, 2009.
Additional course documents
- Ten Simple Rules for the Open Development of Scientific Software (Prlić & Procter, PLoS Comp Biol, 2012)
- Ten Simple Rules for Reproducible Computational Research (Sandve et al., PLoS Comp Bio, 2013).
- So you want to be a computational biologist? (Loman and Watson, Nature Biotech, 2013)
- Best Practices for Scientific Computing (Wilson et al, PLoS Biology, 2014)
For the curious
Here are links if you want to learn more.
- Using named pipes and process substitution in Bioinformatics
- Minimum standards for bioinformatics command line tools by Torsten Seemann.
- Now also published in the journal GigScience!
- SQLite - Working with large data sets in Python effectively by Sebastian Raschka