Till KTH:s startsida Till KTH:s startsida

Gruppwebben som samarbetsyta stängs 31 december 2026. Du som administratör behöver nu exportera gruppens innehåll och/eller radera gruppen.

Observera: Från och med den 1 oktober 2026 kommer delar av gruppwebben som inte längre används, successivt att stängas ned, exempelvis gruppwebbar som redan har flyttats eller varit inaktiva under en längre tid.

Mer information hittar du i nyheten: Gruppwebben och Social stänger hösten 2026. Stöd och instruktioner för hur du exporterar en gruppwebb finns i: Gruppwebben som samarbetsyta stängs hösten 2026.

KLEEK aligned?

Science: Does the KLEEK motif line up?

Note: This assignment is connected to the motif filter assignment.

Determine whether the sequences are conserved enough around the KLEEK motif that its alignment is perfect: the motif sequences are lining up.

  • Take the test file and retrieve the sequences that contain the KLEEK motif.
  • Use the program muscle to compute a multialignment of the KLEEK sequences.
  • Use the alignment viewer seaview to inspect the alignment. How well do the KLEEK motifs align?

To present:

  1. Explain the purpose of multialignment!
  2. Does the KLEEK motif line up in your multialignment?